印章在合同中的真实性对协议有效性至关重要。若印章真实且为签约主体所有，则协议通常被认定有效；但若印章系伪造或盗用，需结合其他证据判断协议效力。当事人可通过鉴定、证人证言等手段证明印章真伪。此外，电子印章同样具有法律效力，其真实性可通过技术手段验证。法院在审理中会综合考量印章与协议内容的一致性及签约过程的合理性。因此，妥善保管印章并规范使用是防范法律风险的关键。